ITI0011RUS:упражнение 03

Срок сдачи упражнения 5-е занятие (18-е февраля).

Общая информация об упражнениях: ITI0011RUS_Practice.
Обратно на страницу предмета.

Описание

ДНК представляет собой последовательность аминокислот, которые обозначают символами A, C, G, T.

Например, “AACCGTAGC” в то же время строки “acgt”, “AJ2IKK”, “AcGTLKO” не являются ДНК, так как содержат посторонние символы.

Задание 1

Проверить, является ли строка sequence ДНК. Если строка содержит посторонние символы, представляет собой null-объект, функция должна вернуть False, иначе True. Имейте в виду, что если передается пустая строка, то функция должна вернуть True

public static boolean isValidDnaSequence(String sequence)

Например: isValidDnaSequence(null) → false isValidDnaSequence(“AAAACCGTAC”) → true isValidDnaSequence(“”) → true isValidDnaSequence(“GKS”) → false isValidDnaSequence(“a”) → false

Задание 2

Посчитать сколько раз встречается каждый из символов и вернуть наибольшее значение. Если строка не является ДКН, то функция должна вернуть -1 (для проверки используйте уже написанную isValidDnaSequence(String sequence) )

       public static int highestOccurrence(String dnaSequence)

Например: highestOccurrence(null) → -1 highestOccurrence(“ACAACCGTGCGC”) → 5 A: 3 раза, C: 5 раз, G: 3 раза, T: 1 раз

Задание 3

Преобразовать ДНК в РНК. Это происходит путем замены символов: A -> U, G -> C, C -> G, T -> A. Если строка не является ДКН, то функция должна вернуть null (для проверки используйте уже написанную isValidDnaSequence(String sequence) )

       public static String transcribe(String dnaSequence) 

Например: transcribe(“AAGGCCTT”) → “UUCCGGAA” transcribe(“TATA”) → “AUAU” transcribe(“klj”) → null

Задание 4

Преобразовать ДНК в белок. Преобразование происходит в 2 этапа: 1. Преобразование ДНК в РНК (используйте transcribe(String dnaSequence) ) 2. Полученная строка разбивается на тройки символов и составляется белок в соответствии с таблицей преобразования

UUU F CUU L AUU I GUU V UUC F CUC L AUC I GUC V UUA L CUA L AUA I GUA V UUG L CUG L AUG M GUG V UCU S CCU P ACU T GCU A UCC S CCC P ACC T GCC A UCA S CCA P ACA T GCA A UCG S CCG P ACG T GCG A UAU Y CAU H AAU N GAU D UAC Y CAC H AAC N GAC D UAA Stop CAA Q AAA K GAA E UAG Stop CAG Q AAG K GAG E UGU C CGU R AGU S GGU G UGC C CGC R AGC S GGC G UGA Stop CGA R AGA R GGA G UGG W CGG R AGG R GGG G

Если строка не является ДКН, то функция должна вернуть null (для проверки используйте уже написанную isValidDnaSequence(String sequence) ) Предполагается, что количество символов в строке кратно 3 (если строка является ДНК)

       public static String translateProtein(String dnaSequence)

Например:

translateProtein(“TTTAAAGGGCCC”) → “KFPG” ДНК → РНК “TTTAAAGGGCCC” → “AAAUUUCCCGGG” разбиение на тройки и преобразование “AAA” → “K”, “UUU” → “F”, “CCC” → “P”, “GGG” → “G”

translateProtein(“AKLFAAAcr”) → null